انجام عمليات اوليه جهت رشد جنين در داخل تخم مرغ تا مرحله بيرون آمدن آن از تخم را جوجه كشي مي گويند. اين فرآيند بسيار پيچيده است و شامل لقاح اسپرم و تخمك و تقسيمات سلولي ميتوز و تمايز و رشد اندامها مي باشد.مراحل اوليه جوجه كشي در داخل بدن مرغ انجام مي شود و مراحل بعدي در خارج بدن مرغ به دو صورت سنتي و صنعتي انجام مي شود. (سنتي توسط مادر و صنعتي توسط مادر مصنوعي يا اصطلاحاً انكوباتور)بهتر ديديم با توجه به اينكه بيشتر در دنيا به صورت صنعتي انجام مي شود به اين مسئله با تفكر بيشتري بپردازيم. طبيعي است كه مرحله تكامل جنين چه در كنار مادر و يا در دستگاه جوجه كشي مشابه مي باشد وليكن اكثر ايرادات به وجود آمده در جوجه در سيستم مصنوعي مي باشد در حالت طبيعي وجود ندارد. چرا كه مادر رابطه خاصي با جنين خود دارد و مي داند كه جنين در هر لحظه به چه چيزي نياز دارد.در اينجا در مورد كل اين فرآيند و اختلالات در روند فرآيند بحث خواهيم نمود.