ميكروفلورطبيعي دستگاه گوارش شامل بيش از 400 گونه ازانواع ميكروارگانيسم هاي مختلف مي باشد كه جمعيتي  بالغ بر1014 جرم زنده را تشكيل ميدهند. حضور اين جمعيت كثير از ميكروارگانيسم ها به دلايل زير براي ميزبان ضروري است :1. كمك به فرآيندهضم مواد غذايي 2. كمك به سنتز و جذب ويتامين ها و مواد معدني3. تجزيه سلولز و ساير پلي ساكاريدها4. تحريك سيستم ايمنيجمعيت ميكـروفلـورطبيـعي روده تحت تاثيـرعوامل مختلفي نظيـر بروز بيماريهاي معدي –روده اي ، تغييـرات جيره غذايي، استفاده ازآنتي بيوتيك ها جهت درمان بيماريها،كمبود تغذيه اي، مسافرت (حمل و نقل)، تراكم بالاي گله، سن، واكسيناسيون و استرس دستخوش تغييراتي ميگردد.از آنجايي كه امروزه در صنعت پرورش طيور، به منظور دستيابي به سطوح بالاي بازده اقتصادي، پرندگان در سيستم هاي  پرورشي متراكم وگله هاي باجمعيتهاي زياد نگهداري و پرورش مي يابند به همين جهت تحت تاثيرعوامل گوناگون درمعرض تنش قرارمي گيرند. همانگونه كه اشاره گرديد اين عوامل منجر به بروزاختلال در تعادل ميكروفلور روده و درنتيجه تضعيف  مكانيسم هاي دفاعي بدن مي گردند و بدين ترتيب اجرام بيماريزا فرصت فعاليت پيدا ميكنند. درچنين شرايطي اغلب به منظور مهـاريا حـذف اجـرام زيـان آورموجـود در روده وهمچنيـن جهت بهبـود بازده غذايـي وافـزايـش تـوليـد،ازافـزودنيـهاي  غذايـي  ضد ميكروبي مانند آنتي بيوتيك ها استفاده مي شود.